一、金融市场的波动性
超级产融结合存在一定风险，这种风险主要来自于金融市场。金融市场和通常意义上的工商业产品市场有所不同，波动性强是其主要特征。长期来看，金融市场是为产业发展提供资本的市场，但是短期而言，由于金融产品价格往往波动性强，带来的风险是与收益并存的，大型企业在投身金融市场时首要考虑的是风险和收益的平衡。建立规范、高效的治理结构和内部风险控制体系，是解决这一问题的重要手段。
二、政策制度的约束性
当前中国的金融市场依然保持着较为严格的管制，可以说整个金融体系依然处于金融市场化的过程之中。例如，由于我国金融市场中存在较多管制，对资本流入流出的管制、对股票发行等的相关规定等，大型企业超级产融结合的空间也受到了一定局限。此外，对于特定的国有大型企业而言，其市场行为要受到国家相关主管部门的制约，其中包含了很多政策性因素，对超级产融结合有较大影响。因此，大型企业超级产融结合一定要在合法合规的前提下进行，不能因为企业产业发展的需要而违反金融监管的相关要求，更不能通过非法的关联交易行为短期为股东谋取利益。
三、人才机制的制约性
大型央企进行超级产融结合，需要大批高端金融人才，并建立符合金融市场要求的激励约束机制。目前，大型央企要受到国资委参照工商制造业特点制订的考核激励体系的监管，其控股的金融企业如何管理，金融人才体系和激励约束机制与原来适应于工商企业特征的体制如何平衡，是首要解决的难题。央企必须突破加工制造业的监管思路和体制，真正建立起符合金融市场规律的机制，才能吸引更多金融人才，使超级产融结合顺利推进。